Největší změnou, která koncem tohoto století zasáhla do osudu zdravotnictví v Děčínském okrese byl rok 1989 a s ním související společenské a ekonomické změny. Došlo k nebývalému rozvoji zdravotní péče co se týká léčebných postupů, způsobů vyšetření, používání léků a dále ke změně přístupu lékaře k pacientovi a pacientů k lékaři, ke změnám vlastnických vztahů. Mnohé činnosti zdravotní péče byly převedeny do soukromých rukou metodou privatizace, což se týkalo v prvé řadě hlavně stomatologů a lékáren, dále následovali praktičtí lékaři a odborní specialisté.
Z mohutné organizace OÚNZ vzniklo mnoho nových subjektů, jak soukromých lékařů, tak i zdravotnických zařízení. V roce 1992 vznikla jako samostatná jednotka i Nemocnice s poliklinikou, která zahrnovala nejen areál Nemocnice v Děčíně, ale také budovu polikliniky a mnoho obvodních středisek včetně areálu Nemocnice v České Kamenici s přilehlými budovami. V roce 1996 se s nástupem nového vedení zintensivnila snaha oddělit všechny činnosti nesouvisející přímo s nemocniční péčí. Tato strategie měla snížit náklady a zvýšit ekonomiku provozu a tohoto cíle také dosáhla. Nemocnice Děčín zůstala jako jednotný celek v areálu v Děčíně II a zajišťuje státem garantovanou akutní lůžkovou péči pro spádovou oblast okresu Děčín, což je pro 132 000 obyvatel v oborech :

Chirurgie ...................................	59 lůžek
Interna .....................................	86 lůžek
Dětské včetně novorozeneckého ...	48 lůžek
Ženské včetně porodnice .............	45 lůžek
Neurologie .................................	29 lůžek
ARO .........................................	5 lůžek
ORL .........................................	20 lůžek
Oční ........................................	15 lůžek
Ošetřovatelská lůžka ..................	22 lůžek
Celkem ...................................	329 lůžek

Tyto činnosti jsou dále doplněny ambulantními složkami, jako :RDG, OKB, HTO, Hemodialýza, Rehabilitace, Urologie, Alergologie, Logopedie a další odborné ordinace a poradny.
K činnosti nemocnice jsou zapotřebí také další střediska, jako radiologické oddělení (dříve rentgenové oddělení) vybavené moderní rentgenovou a sonografickou technikou a přístrojem CT od firmy Siemens, které splňují nejpřísnější limity stanovené atomovým zákonem a laboratoře (hematologická a klinické biochemie), které jsou vybaveny moderní diagnostickou technikou představovanou automatickými analyzátory napojenými na počítačovou síť.
Nezbytnou složkou je i patologické oddělení. K výše uvedené poskytované péči patří také zajištění sanitní dopravy v jižní části okresu Děčín, pro pacienty, jejichž stav to na základě vyjádření lékaře vyžaduje.
O pacienty se stará celkem 71 lékařů a 330 sester z celkového počtu 640 zaměstnanců. Nemocnice má k dispozici celkem 8 operačních sálů (2 chirurgické, 2 gynekologické, 2 oční a 2 ORL). V rámci zajištění dokonalého a rychlého zásahu byla všechna oddělení vybavena mobilními telefony, aby službu konající lékař mohl být v nutném případě vždy okamžitě přivolán.
Pro zkvalitnění služeb pro pacienty jsou návštěvní hodiny od 14 do 20 hodin (vyjma specializovaných oddělení JIP a ARO), v případě dohody i mimo tyto hodiny.
Stravování je zajištěno modernizovaným stravovacím provozem a jednotlivým pacientům rozváženo v termicky chráněných obalech. Pokud si to pacient přeje, může být ubytován na pokoji s nadstandardním vybavením, na jednolůžkovém pokoji s barevnou televizí, telefonem a samostatným sociálním zařízením.